曾用刊名：上海水产大学学报
《上海海洋大学学报》（原《上海水产大学学报》）创刊于1992年，是由上海市教委主管、上海海洋大学主办，以水产科学技术为主的综合性学术期刊。在反映学校各学科科学研究的同时，兼收国内外水产行业最新科学研究动态和成果，促进了学术与教学研究的交流与繁荣。至2017年《上海海洋大学学报》已出版了26卷，期页码为160页。
《上海海洋大学学报》每年与日本、韩国、菲律宾、英国、加拿大等国的有关机构和图书馆建立期刊交流关系，并通过中国国际图书贸易总公司对国外发行。除书本式发行外，《上海海洋大学学报》还加入了《中国知网》的独家代理发行，并从2013年开始参加中国知网的优先出版，使作者的文章能第一时间面向读者。
据2017年版《中国科技期刊引证报告（核心版）》（中国科学技术信息研究所）数据显示，《上海海洋大学学报》影响因子为0.575，在全国水产类科技期刊中排名第6位，总被引频次为969。他引率为0.94，综合评价排名位居水产渔业类期刊第6位。据2013年版《中国科技期刊引证报告（扩刊版）》（中国科学技术信息研究所）数据显示，《上海海洋大学学报》影响因子为0.799，总被引频次为1430。
《上海海洋大学学报》作为文献源被《化学文献》（CA）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ,VINITI）、日本《CBST 科学技术文献速报》、《日本科学技术振兴机构中国文献数据库》、《水科学和渔业文摘》（ASFA）、《中国科学引文数据库（CSCD）》、《中国生物学文摘》、《中国水产文摘》等众多国内外检索期刊收录。
《上海海洋大学学报》被北京大学图书馆定为“中文核心期刊”、被中国科学院文献情报中心定为“中国科学引文数据库来源期刊”、被中国科学技术信息研究所定为“中国科技核心期刊”。
2006年，《上海海洋大学学报》荣获教育部科学技术司颁发的“首届中国高校优秀期刊奖”，2013年、2014年连续两年获得教育部科技发展中心颁发的“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖，2014年荣获教育部科学技术司颁发的“第五届中国高校优秀期刊奖”。